Holeby er en gammel industriby, som i dag er præget af mindre erhvervsvirksomheder inden for frøforædling.
Europas største byggeprojekt i Rødbyhavn, Femern Bælt-tunnelen, sætter også sit præg på Holeby i form af beskæftigelse.
Holeby har et større erhvervsområde beliggende 1 km fra afkørsel 49 på motorvej E45.